Medlemmar i förbundet kan vara statliga och kommunala organ, organisationer och sammanslutningar eller enskilda personer. Den gemensamma nämnaren är att man är verksam inom miljöområdet eller har intresse för frågorna.
Idag har Sveriges miljökommuner ca 220 medlemmar, varav majoriteten är kommunernas miljönämnder, kommunalförbund eller gemensamma nämnder för flera kommuner. De 18 kommunalförbund och gemensamma nämnder som är medlemmar representerar tillsammans 50 kommuner. Totalt är alltså 214 av Sveriges 290 kommuner medlemmar i förbundet.
Medlemsavgifter Sveriges miljökommuner
Medlemsavgifterna i förbundet höjdes genom beslut av årsmötet 2017 efter att ha varit oförändrade i ungefär ett decennium. Följande avgifter gäller from 2018:
| Medlemskategori | Medlemsavgift 2017 | Medlemsavgift 2018 |
| Kommuner, invånarantal | ||
| -9.999 | 800 kronor | 1 000 kronor |
| 10.000-29.999 | 1 500 kronor | 1 800 kronor |
| 30.000-49.999 | 1 800 kronor | 2 200 kronor |
| 50.000-99.999 | 2 300 kronor | 2 800 kronor |
| 100.000- | 4 000 kronor | 4 800 kronor |
| Övriga | ||
| Centrala och regionala sammanslutningar | 900 kronor | 1 100 kronor |
| Lokala organ och företag | 500 kronor | 600 kronor |
| Enskild medlem | 100 kronor | 100 kronor |